Cueva Paleo es un lugar de gran importancia dentro del juego, ya que luego de vencer al lider de Gimnasio de Sinnoh: Roco, este te dirá que hace muchos años la cueva estaba habitada por Pokémon prehistoricos, que son resistentes a las condiciones hostiles de la misma y cuando termine, te pedirá que le ayudes a repoblarla llevandole Pokémon revividos de fósiles al Nivel 5.
